2020年8月，中国医学科学院血液病医院（中国医学科学院血液学研究所）程涛教授领衔的多个研究组系统绘制了人各类血细胞的精细转录组图谱（Atlas of Blood Cells，ABC）。该研究覆盖了从造血干细胞到祖细胞再到各谱系成熟血细胞在内的32种类型的血细胞，借助单细胞转录组深度测序，揭示了全新的与造血分化相关的lncRNAs和转录因子，并对主要血细胞群体进行精细分群和精确定义。该图谱全面地整合了血细胞的转录组信息和免疫表型信息，为后续血液生理学和病理学研究提供了重要的血细胞注释依据和参考价值。相关研究成果发表在National Science Review。

参考人血细胞图谱（ABC）的转录组注释，程涛教授与朱平副研究员、周剑峰教授等研究团队合作，进一步在单细胞水平详细解析了不同严重程度新冠肺炎患者外周血的转录组动态学变化。该研究涵盖普通型、重型和危重型三种严重程度，借助10x genomics平台完成外周血单个核细胞建库和测序。研究发现，增殖型CD8效应T细胞和自然杀伤（NK）细胞的数量以及免疫功能随着新冠肺炎严重程度呈现非单调的异质性变化。对于单核细胞而言，其细胞数量、免疫功能以及转录因子NFKB、IRF等的调控活性均是随着新冠肺炎严重程度先升高后降低。此外，新冠肺炎患者中NK/T细胞和单核细胞之间存在频繁的细胞相互作用，并由炎性细胞因子所介导。相关工作于2021年2月4号在线发表在SCIENCE CHINA Life Sciences期刊上，题为“Single-cell transcriptomes of peripheral blood cells indicate and elucidate severity of COVID-19”。所院程涛教授、朱平副研究员与华中科技大学同济医学院周剑峰教授为共同通讯作者。所院谢小韦、程雪莲、张标与同济医学院王高翔为共同第一作者。

与此同时，程涛教授带领多位研究人员积极参与“新冠肺炎单细胞研究中国联盟”，并将上述数据汇总于新冠单细胞联盟进行整合分析。该联盟汇集全国四十多家医院、大学和研究机构，共获得196个新冠肺炎病人的284个样本（包括痰液、肺泡灌洗液、胸水、外周血等）超过25T近150万个细胞的单细胞转录组测序数据。研究提示新冠病毒宿主细胞范围不仅包括上皮细胞还有可能包括免疫细胞。此外，研究详细解析了严重程度、病程阶段、年龄、性别以及其他因素对外周血中免疫细胞组成的影响；进一步验证了单核细胞以及巨核细胞为细胞因子的潜在细胞源头。相关工作于2021年2月3号在线发表在Cell期刊上，题为“COVID-19 immune features revealed by a large-scale single cell transcriptome atlas”。所院程涛教授为共同通讯作者。点击查看原文   

上述新冠肺炎相关研究，参考人血细胞图谱（ABC），在单细胞层面揭示了新冠患病程度的免疫特征和分子基础，对新冠疫情的防控、新冠的药物靶点研究、特别是重症患者的治疗具有重要的意义。而所院作为非感染医院，从2020年2月开始，一直积极投入在新冠肺炎的研究工作之中，为抗疫贡献了自己的宝贵力量。

撰稿：谢小韦

编辑：董源

校对：徐龙彪

审核：郝莎